Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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