Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim44Q9QXA7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim44Q9QXA7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms