Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc5Q9QX29 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms