Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms