Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gde1Q9JL56 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms