Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms