Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Chrac1Q9JKP8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chrac1Q9JKP8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms