Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms