Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl28Q9JIL2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms