Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cwc15Q9JHS9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cwc15Q9JHS9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cwc15Q9JHS9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms