Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtn3Q9ES97 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtn3Q9ES97 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rtn3Q9ES97 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rtn3Q9ES97 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rtn3Q9ES97 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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