Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp29Q9ES63 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp29Q9ES63 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp29Q9ES63 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp29Q9ES63 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp29Q9ES63 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp29Q9ES63 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp29Q9ES63 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp29Q9ES63 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp29Q9ES63 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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