Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfcp2Q9ERA0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfcp2Q9ERA0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms