Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rhox9Q9EQM5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rhox9Q9EQM5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rhox9Q9EQM5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rhox9Q9EQM5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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