Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SyncQ9EPM5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SyncQ9EPM5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SyncQ9EPM5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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