Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TnmdQ9EP64 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TnmdQ9EP64 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms