Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tsc1Q9EP53 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tsc1Q9EP53 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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