Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Xab2Q9DCD2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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