Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtr1Q9DBC3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms