Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Znf580Q9DB38 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Znf580Q9DB38 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Znf580Q9DB38 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Znf580Q9DB38 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf580Q9DB38 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf580Q9DB38 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf580Q9DB38 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf580Q9DB38 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf580Q9DB38 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf580Q9DB38 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf580Q9DB38 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf580Q9DB38 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Znf580Q9DB38 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Znf580Q9DB38 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Znf580Q9DB38 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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