Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc89Q9DA73 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms