Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smco2Q9DA21 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smco2Q9DA21 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms