Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg7Q9D906 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg7Q9D906 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms