Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam3aQ9D8T0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms