Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c6Q9D8P7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gtf3c6Q9D8P7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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