Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins2Q9D600 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins2Q9D600 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms