Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PudpQ9D5U5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PudpQ9D5U5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PudpQ9D5U5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PudpQ9D5U5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PudpQ9D5U5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PudpQ9D5U5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PudpQ9D5U5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PudpQ9D5U5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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