Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfap53Q9D439 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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