Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx29Q9D3S3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx29Q9D3S3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms