Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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