Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Mrpl53Q9D1H8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Mrpl53Q9D1H8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms