Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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Mrpl28Q9D1B9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl28Q9D1B9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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