Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms