Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gins3Q9CY94 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gins3Q9CY94 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Gins3Q9CY94 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gins3Q9CY94 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms