Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ube2fQ9CY34 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms