Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Sgo1Q9CXH7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sgo1Q9CXH7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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