Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cdca4Q9CWM2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms