Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MINDY3Q9CV28 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms