Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Atg12Q9CQY1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Atg12Q9CQY1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms