Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccer1Q9CQL2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms