Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg3Q9CPX6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms