Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Bhlhe41Q99PV5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Bhlhe41Q99PV5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms