Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ms4a6bQ99N09 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ms4a6bQ99N09 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms