Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrrtQ99MR6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SrrtQ99MR6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms