Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rab28Q99KL7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rab28Q99KL7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms