Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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TrabdQ99JY4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TrabdQ99JY4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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