Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Apobec3Q99J72 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec3Q99J72 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms