Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim11aQ99J19 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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