Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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CsprsQ99388 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CsprsQ99388 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms