Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim59Q922Y2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms